本报讯　由美国能源部启动并实施的杨树全基因组测序计划日前完成,9月21日对公众开放了全序列数据库。这是继拟南芥和水稻之后第三个测定全序列的植物,并且是第一个测定全基因组序列的多年生木本植物。南京林业大学科研人员参与了此项研究。

    杨树全基因组全序列用“鸟枪法”测定,序列库共含有764.9993万个序列片段,去除叶绿体基因组的污染,测得的序列大约为8×基因组长度。目前对序列拼接的组装已完成杨树基因组物理全长的90%以上,基本覆盖了杨树基因组常染色体的大部分。基于基因芯片和单核苷酸多态性检测技术,对小的序列拼接及序列间隙的填充工作正在进行中,预期这部分工作将于明年完成。南京林业大学尹佟明副教授自2001年以来一直参与此项研究,目前对杨树基因组的注释工作将于今年12月初完成。杨树基因组的新闻发布及庆祝会将于今年12月6日～10日在美国加州举行。

    杨树是世界上重要的工业用材树种,杨树全基因组计划实施的初衷是为生物能源开发提供知识贮备,因此杨树全序列的测定也具有重要的应用价值。重要的栽培作物一般都经历了几千年的改良历程。杨树的改良还处在一种半野生的初级改良阶段,在基因组研究基础上,通过群体和数量遗传学的手段在杨树属不同树种间开发有用等位基因,并通过遗传工程的手段进行基因重组,这样有望在几十年时间里完成作物几千年的改良历程。(周统建)